Sin embargo, en junio de 2001 fue el propio Gallego quien decidió dar un paso al costado después de quedar eliminado en cuartos de final de la Copa Libertadores 2001 frentre a Cruz Azul de México y estar lejos en la pelea por el Torneo Clausura 2001. -aunque luego terminó subcampeón a 6 puntos-. A pesar de los títulos obtenidos, a principios de 2001 gran parte de la dirigencia quería despedir al entrenador.